جایزه ثبوتی-خواجه پور از طرف هیأت امنای جایزه ثبوتی-خواجه پور همه ساله به پژوهشگران علوم پایه داده می شود که این پژوهشگران زیر ۴۰ سال و ساکن ایران هستند و کارهای پژوهشی با کیفیت انجام داده اند. کار دکتر نجفی که موجب انتخاب ایشان گردیده مربوط به طراحی و بررسی حرکت ماشین های مولکولی در اندازه های میکرومتری بوده است.
برای اجرای مراسم از هیچ ارگان دولتی درخواست حمایت مالی نشده است. در واقع متصدیان اجرای مراسم خود از حامیان تأمین جوایز و هدف اصلی نیز برجسته سازی اخذ رأی اساتید بزرگ و دانشمندان کشور در حل مسائل علمی است. در مراسم اعطای این جایزه، علی نجفی، عضو هیأت علمی دانشگاه زنجان در رشته فیزیک، محمدعلی آبام عضو هیأت علمی دانشگاه صنعتی شریف در رشته ریاضی و ایمان افتخاری در علوم رایانه از پژوهشگاه دانش های بنیادی مورد تقدیر قرار گرفته و جایزه ثبوتی خواجه پور را دریافت کردند.
این جایزه امسال به حیطه فیزیک ریاضی و علوم رایانه اعطا شده و سال بعد به رشته های شیمی و زیست شناسی داده می شود.